Heerbrugg ligger i St. Galler Rhindal og er et vigtigt trafikknudepunkt, der er godt forbundet med offentlig transport. Bosættelsen strækker sig over dalbunden mellem Rhinen og blidt stigende skråninger med udsigt til de omkringliggende alper. Byen er præget af en blanding af boligområder, erhverv og forskningsinstitutter tæt på industrien. Beliggenheden langs Rhinen og i forlandet til Alperne gør Heerbrugg til et populært udgangspunkt for udflugter.