Bönigen a Brienzer-tónál helyezkedik el Bern északnyugati partján, a Berner Oberlandban. A falu központja a Lütschine folyó mentén húzódik a község északi határánál a tóig, majdnem összekötve Interlakennel. A faluban festői faházakat találunk, többnyire a 16. századból. A legtöbb terület meredek hegyoldalból áll. Ennek csúcsán található a Loucherhorn, a Roteflue és a Schynige Platte. A tó menti séták vagy kerékpártúrák a Lütschine folyónál nagyon pihentetőek. Bönigenből szívesen indulnak kajak- vagy jet boat-túrák a Brienzer-tavon.