Bönigen terletak di tepi selatan Danau Brienz di Berner Oberland. Pusat desa Bönigen membentang di sepanjang perbatasan barat laut desa di Lütschine hingga danau dan hampir terhubung dengan Interlaken. Di desa ini terdapat rumah kayu yang indah, sering kali sudah berasal dari abad ke-16. Bagian terbesar dari desa ini terdiri dari lereng gunung yang curam. Di puncaknya terdapat Loucherhorn, Roteflue, dan Schynige Platte. Jalan-jalan di sepanjang danau atau bersepeda di sepanjang Lütschine sangat menyenangkan. Dari Bönigen, banyak yang melakukan tur kayak atau tur Jet Boat di Danau Brienz.